MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 8370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	GTAA	2	8	16	23	50 %	25 %	25 %	0 %	400404026
2	NC_018415	TTC	2	6	42	47	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404026
3	NC_018415	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
4	NC_018415	A	7	7	105	111	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
5	NC_018415	AT	3	6	145	150	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
6	NC_018415	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
7	NC_018415	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	400404026
8	NC_018415	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
9	NC_018415	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
10	NC_018415	AGAA	2	8	327	334	75 %	0 %	25 %	0 %	400404026
11	NC_018415	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
12	NC_018415	TAA	3	9	378	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
13	NC_018415	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
14	NC_018415	A	7	7	434	440	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
15	NC_018415	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
16	NC_018415	A	6	6	459	464	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
17	NC_018415	TTA	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
18	NC_018415	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
19	NC_018415	A	7	7	522	528	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
20	NC_018415	T	6	6	543	548	0 %	100 %	0 %	0 %	400404026
21	NC_018415	A	7	7	555	561	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
22	NC_018415	A	7	7	567	573	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
23	NC_018415	TAT	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
24	NC_018415	TAA	2	6	600	605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
25	NC_018415	TTTA	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	400404026
26	NC_018415	TAC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404026
27	NC_018415	AACAA	2	10	753	762	80 %	0 %	0 %	20 %	400404026
28	NC_018415	ATTT	2	8	763	770	25 %	75 %	0 %	0 %	400404026
29	NC_018415	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
30	NC_018415	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404026
31	NC_018415	TAAAAA	2	12	809	820	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	400404026
32	NC_018415	A	6	6	822	827	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
33	NC_018415	A	6	6	836	841	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
34	NC_018415	A	6	6	852	857	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
35	NC_018415	TAAA	2	8	860	867	75 %	25 %	0 %	0 %	400404026
36	NC_018415	ATATT	2	10	886	895	40 %	60 %	0 %	0 %	400404026
37	NC_018415	GATA	2	8	897	904	50 %	25 %	25 %	0 %	400404026
38	NC_018415	AATTT	2	10	905	914	40 %	60 %	0 %	0 %	400404026
39	NC_018415	T	7	7	945	951	0 %	100 %	0 %	0 %	400404026
40	NC_018415	AATAA	2	10	952	961	80 %	20 %	0 %	0 %	400404026
41	NC_018415	AAAT	2	8	962	969	75 %	25 %	0 %	0 %	400404026
42	NC_018415	AAT	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
43	NC_018415	TAT	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
44	NC_018415	AAAT	2	8	987	994	75 %	25 %	0 %	0 %	400404026
45	NC_018415	A	7	7	1008	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
46	NC_018415	A	6	6	1032	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
47	NC_018415	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
48	NC_018415	A	6	6	1062	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
49	NC_018415	AT	3	6	1078	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404026
50	NC_018415	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
51	NC_018415	ATT	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
52	NC_018415	AATA	2	8	1131	1138	75 %	25 %	0 %	0 %	400404026
53	NC_018415	AATTA	2	10	1142	1151	60 %	40 %	0 %	0 %	400404026
54	NC_018415	TAT	2	6	1166	1171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
55	NC_018415	T	6	6	1187	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	400404026
56	NC_018415	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404026
57	NC_018415	ATT	3	9	1219	1227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404026
58	NC_018415	TAA	2	6	1235	1240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
59	NC_018415	A	9	9	1247	1255	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
60	NC_018415	AAT	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404026
61	NC_018415	A	6	6	1293	1298	100 %	0 %	0 %	0 %	400404026
62	NC_018415	T	7	7	1302	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	400404026
63	NC_018415	ATTATA	2	12	1341	1352	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
64	NC_018415	TCT	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404027
65	NC_018415	TAA	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
66	NC_018415	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
67	NC_018415	AGAAAT	2	12	1499	1510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400404027
68	NC_018415	AAT	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
69	NC_018415	ATT	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
70	NC_018415	A	6	6	1575	1580	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
71	NC_018415	TA	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
72	NC_018415	ATT	3	9	1646	1654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
73	NC_018415	A	9	9	1658	1666	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
74	NC_018415	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
75	NC_018415	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
76	NC_018415	TTA	2	6	1699	1704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
77	NC_018415	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
78	NC_018415	TA	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
79	NC_018415	TAA	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
80	NC_018415	A	7	7	1740	1746	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
81	NC_018415	T	9	9	1747	1755	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
82	NC_018415	A	6	6	1757	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
83	NC_018415	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
84	NC_018415	A	6	6	1811	1816	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
85	NC_018415	A	6	6	1843	1848	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
86	NC_018415	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
87	NC_018415	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
88	NC_018415	TA	3	6	1877	1882	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
89	NC_018415	TA	4	8	1885	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
90	NC_018415	CCA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400404027
91	NC_018415	ATAG	2	8	1923	1930	50 %	25 %	25 %	0 %	400404027
92	NC_018415	A	7	7	1947	1953	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
93	NC_018415	TATACA	2	12	1974	1985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	400404027
94	NC_018415	T	6	6	1996	2001	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
95	NC_018415	ATA	3	9	2008	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
96	NC_018415	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
97	NC_018415	TA	3	6	2058	2063	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
98	NC_018415	A	9	9	2063	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
99	NC_018415	A	7	7	2075	2081	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
100	NC_018415	T	7	7	2089	2095	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
101	NC_018415	ATA	2	6	2103	2108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
102	NC_018415	TAA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
103	NC_018415	T	7	7	2182	2188	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
104	NC_018415	TAG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404027
105	NC_018415	AATT	2	8	2266	2273	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
106	NC_018415	A	8	8	2291	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
107	NC_018415	TAT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
108	NC_018415	ATATA	2	10	2318	2327	60 %	40 %	0 %	0 %	400404027
109	NC_018415	T	7	7	2392	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
110	NC_018415	TAC	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404027
111	NC_018415	GAA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404027
112	NC_018415	GCA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404027
113	NC_018415	TAT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
114	NC_018415	A	7	7	2507	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
115	NC_018415	TAA	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
116	NC_018415	ATT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
117	NC_018415	ATT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
118	NC_018415	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404027
119	NC_018415	AAT	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404027
120	NC_018415	A	7	7	2739	2745	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
121	NC_018415	T	9	9	2760	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	400404027
122	NC_018415	ATAATT	2	12	2778	2789	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
123	NC_018415	AT	3	6	2807	2812	50 %	50 %	0 %	0 %	400404027
124	NC_018415	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	400404027
125	NC_018415	T	9	9	2838	2846	0 %	100 %	0 %	0 %	400404028
126	NC_018415	A	7	7	2847	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	400404028
127	NC_018415	TTAAAT	3	18	2860	2877	50 %	50 %	0 %	0 %	400404028
128	NC_018415	ATA	3	9	2884	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
129	NC_018415	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	400404028
130	NC_018415	ATTT	2	8	2910	2917	25 %	75 %	0 %	0 %	400404028
131	NC_018415	TAT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
132	NC_018415	A	6	6	2931	2936	100 %	0 %	0 %	0 %	400404028
133	NC_018415	TAA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
134	NC_018415	ATTTT	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
135	NC_018415	ATT	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404028
136	NC_018415	A	7	7	2967	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	400404028
137	NC_018415	A	7	7	2979	2985	100 %	0 %	0 %	0 %	400404028
138	NC_018415	ATTTT	2	10	3013	3022	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
139	NC_018415	T	7	7	3019	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	400404028
140	NC_018415	TAA	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404028
141	NC_018415	TATTT	2	10	3045	3054	20 %	80 %	0 %	0 %	400404028
142	NC_018415	TAATT	2	10	3081	3090	40 %	60 %	0 %	0 %	400404028
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